15 czerwca 2008 roku przypadła 202. rocznica konsekracji kościoła Trójcy Świętej na Świętym Krzyżu. Podczas Mszy Świętej w sanktuarium dziękowano Bogu w Trójcy Przenajświętszej za wszelkie łaski i błogosławieństwa udzielane pielgrzymom oraz modlono się o przywrócenie integralności budynków klasztornych, które po dziś dzień naznaczone są podziałem z czasów zaboru. Nowa świątynia została wzniesiona i konsekrowana 15 czerwca 1806 roku po rozebraniu wcześniejszej zniszczonej pożarem w 1777 roku. Staraniem opata benedyktynów świętokrzyskich Jana Nepomucena Niegolewskiego wzniesiono neoklasycystyczny kościół ze stallami dla zakonników, bocznymi ołtarzami i pięknymi organami. W uroczystości konsekracji kościoła pod przewodnictwem biskupa krakowskiego Andrzeja Gawrońskiego udział wzięło ponad dwustu kapłanów i 24 tys. wiernych. To wydarzenie upamiętnia marmurowa tablica z łacińską inskrypcją z 1806 roku umieszczona w południowej części krużganków.